重庆分公司,新征程启航
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下面就来介绍一下simplifyEnrichment包是如何展示GO富集结果的。这里用该包中数据做一个演示。
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默认展示circ 数据前10个GO Term,通过参数 nsub 调整需要展示的GO Term chord_dat ()将作图数据构建成GOChord() 要求的输入格式;一个二进制的关系矩阵, 1 表示基因属于该GO Term, 0 与之相反。
set,可以是差异表达基因,也可是正选择基因或者加速进化基因。通常,只要具有这些基因的gene symbol或者是geneid,都可以利用该软件进行分析。
clusterProfiler是一个功能强大的R包,同时支持GO和KEGG的富集分析,而且可视化功能非常的优秀,本章主要介绍利用这个R包来进行Gene Ontology的富集分析。
首先,打开 TBtools GO 富集分析界面 整体如上,一共三个文件:具体示例如下 点击 Start ,随后等待即可。完成时会有弹窗提示。
topGO是一个半自动的GO富集包,该包的主要优势是集中了好几种统计检验的方法,目前支持的统计方法如下:BiocManager:install(topGO)需要R的版本为=10,但biocmanager安装需要的R版本更高,现在应该是6。
1、golang 中 map的实现结构为: 哈希表 + 链表。 其中链表,作用是当发生hash冲突时,拉链法生成的结点。可以看到, []bmap 是一个hash table, 每一个 bmap是我们常说的“桶”。
2、创建需要使用的embed.FS对象 静态资源目录如下:这里注意,//go:embed static注释会引导Static embed.FS寻找到我们的静态资源目录,因此务必不要遗漏设置。
3、前面,我们讲了map的用法以及原理 Golang中map的实现原理 ,但我们知道,map在并发读写的情况下是不安全。
1、百度,脸书等产品,用的就是PHP,不过,近些年,PHP在编程语言的排行榜上的排名有所下降。再来说说Python,最开始的话作为胶水语言存在。可是随着人工智能的兴起,Python一跃成为最火的编程语言。
2、1)各种编程语言涌现。如:Go、Swift、Rust、Dart、Kotlin等等,虽然有些并不直接和PHP有竞争关系;这些现代的编程语言,吸引了不少人学习;2)移动互联网的兴起。
3、PHP主要用来做网站开发,许多小型网站都用PHP开发,PHP是开源的,这是使得PHP经久不衰的原因。在电商、社区等方面,PHP具备非常成熟的开源代码和模板,因此使得PHP应用极为广泛。劣势是受众较小,有可替代性。
4、这背后的一个重要原因就是Java非常,因为我把它列为2021年要注意的编程语言的前10名。它的Write-Once-Run-Anywhere功能允许在一台机器上初始设置代码并在另一台机器上运行。
5、PHP的优劣势 PHP主要用于网站的开发,很多小网站都是用PHP开发的。PHP是开源的,这是PHP得以长久的原因。在电子商务,社区等领域,PHP应用程序非常广泛,因为PHP提供了非常成熟的开放源代码和模板。