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JBrowse安装配置的步骤

本篇内容介绍了“JBrowse安装配置的步骤”的有关知识,在实际案例的操作过程中,不少人都会遇到这样的困境,接下来就让小编带领大家学习一下如何处理这些情况吧!希望大家仔细阅读,能够学有所成!

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我用的是阿里云服务器Ubuntu系统

按照 JBrowse使用说明:如何安装JBrowse这篇教程中的步骤进行安装 用到的命令是

sudo mkdir /var/www/jbrowse
sudo chown `whoami` /var/www/jbrowse
cd /var/www/jbrowse

# unzip it and cd into it
unzip JBrowse-1.16.9.zip
cd JBrowse-1.16.9
# run setup.sh, quick start with example data
./setup.sh
 

这里需要注意的是sudo chown `whoami` /var/www/jbrowse 这行命令里 不是单引号,而是ESC键下面那个

./setup.sh这一步会运行好长时间,因为需要安装好多依赖的perl模块,这里吐槽一下perl模块的安装好麻烦,或者是我自己没有掌握正确的安装方法吧!

我的nginx已经安装好了 在自己的电脑浏览器输入http://123.56.89.209/jbrowse/JBrowse-1.16.9/index.html?data=sample_data/json/volvox

报错JBrowse安装配置的步骤

暂时还不知道是什么原因

然后我将 /var/www/html/目录下的index.nginx-debian.html文件删除掉了(记得备份),然后将 /var/www//jbrowse/JBrowse-1.16.9/目录下的所有内容都复制到了/var/www/html/目录下

cp -R ../jbrowse/JBrowse-1.16.9/* ./
 

然后在自己本地电脑浏览器输入http://123.56.89.209/index.html?data=sample_data/json/volvox

终于看到了结果

JBrowse安装配置的步骤
image.png

“JBrowse安装配置的步骤”的内容就介绍到这里了,感谢大家的阅读。如果想了解更多行业相关的知识可以关注创新互联网站,小编将为大家输出更多高质量的实用文章!


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